SCP: 5K

В SCP: Pandemic игрок управляет преступной боевой группировкой, бросившей вызов Фонду SCP. Их целью является полное уничтожение программы Psi-Z. Она заключается в искусственном создании сущностей, которых будут использовать как машины для убийства. Чтобы получить этих монстров, ученые объединили биологические конструкции нескольких существ. Полученные создания умеют не только убивать, но и распространять инфекцию, вызывающую масштабные заражения людей. Разработка проекта происходит в Зоне 12. Эту территорию главным героям тоже предстоит разрушить.

Сюжет SCP: Pandemic рассказывает о секретной неправительственной организации, усилия которой направлены на обеспечение лучшей жизни для человеческой расы. Раньше здесь занимались изучением и предотвращением аномалий, но все поменялось, когда сотрудники организации обнаружили в психике человека инородное тело, представляющее серьезную угрозу, под названием SCP-5000. Это существо необходимо уничтожить, а для этого придется истребить человечество. Многие члены Фонда, не согласные с таким решением, устраивали бунты и дезертировали. Но приверженцы плана убеждены, что продолжение жизни означает нездоровое стремление к полному исчезновению человечности. Они не желают этого допускать, поэтому запускают ряд проектов по нападению на гражданских.